La EOS-1D Mark IV incluye modo AF puntual (Spot AF) para enfocar en un área más reducida y precisa. Requiere un objetivo con botones de parada AF (como el EF 300mm f/2.8L IS USM). Mediante C.Fn III-6 opción 7, los botones de parada AF activan el Spot AF, que usa una zona menor del sensor AF. Cuando se activa, el punto AF parpadea más intensamente.