Si al conectar tu iPod a la entrada auxiliar del Bose 321 el volumen es muy bajo comparado con un CD, la causa casi siempre es el nivel de salida del propio iPod.
La amplificación del sistema depende del nivel de señal de entrada (dB). El iPod entrega una señal de menor voltaje que un reproductor de CD. Al subir el volumen en el iPod, elevas ese nivel de entrada y el Bose puede amplificar con su ganancia normal, recuperando nitidez y nivel.
Si tras subir al máximo en el iPod sigue bajo, prueba con otro cable auxiliar o verifica que la entrada AUX del Bose no tenga ganancia reducida en su menú (algunos modelos permiten ajustar ganancia por entrada).