El síntoma (solo suena el sintonizador AM/FM; CD, USB, AUX mudos) revela que has usado el cable de la antena eléctrica (azul sólido) como «remote turn‑on» del amplificador de fábrica.
Ese cable solo entrega 12 V cuando la radio está en modo Tuner (AM/FM). Al cambiar a CD/USB/AUX, la radio corta la alimentación a la antena y, por tanto, el amplificador se apaga.
Usa el cable azul/blanco (blue/white) de la radio aftermarket, que es la salida «System Remote / Amp Turn‑On» y entrega 12 V constantes mientras la radio está encendida, independientemente de la fuente. Conecta ese cable al borne de encendido remoto del amplificador de fábrica (o al arnés adaptador que lo lleve).
Resultado: sonido en todas las fuentes. ¡Suerte!