En Galaxy S III (GT-I9300) para borrar múltiples entradas del registro de llamadas agrupadas por contacto:
En versiones antiguas de TouchWiz: Registro > Menú > Eliminar > "Seleccionar por contacto" / "Seleccionar todo".
Si no ves la opción, actualiza la app Teléfono (Play Store) o usa app de contactos de terceros (Truecaller, Drupe) que permiten borrado masivo.