Prácticamente todos los códigos de construcción exigen un sistema de ventilación sobre la estufa. Este sistema incluye una luz que ilumina la superficie de cocción y un ventilador que elimina humo y vapor. Los microondas over-the-range integran luz y ventilador en su parte inferior; tras filtrar el aire, lo expulsan al exterior o lo recirculan limpio en la cocina.
Si el microondas tiene salida de ventilación física, el aire se impulsa a través de conductos hasta el exterior. Esta instalación requiere tender conductos desde el mueble superior hasta la pared exterior, lo que puede ser complejo y costoso en viviendas ya construidas.
Muchos modelos usan filtros de carbón activado que atrapan contaminantes antes de devolver el aire a la cocina. Aunque menos eficientes que la extracción al exterior, mejoran notablemente la calidad del aire respecto a no tener ningún sistema. Los filtros deben cambiarse cada seis meses o según uso.
La extracción al exterior garantiza el aire más limpio, pero su instalación en cocinas existentes suele ser cara y laboriosa. Los filtros de carbón son una alternativa práctica sin obras, aunque requieren mantenimiento periódico. La elección final depende de la estructura de la vivienda y del presupuesto.