Si la actualización llegó oficialmente de Samsung (notificación OTA o vía Kies), lo ocurrido es normal: el salto de versión de Android (probablemente a 4.4.2 KitKat) limpia la partición de datos de usuario de muchas apps. La solución es reinstalar los juegos y volver a iniciar sesión para recuperar el progreso guardado en la nube.
Si instalaste un archivo ZIP de origen desconocido, una ROM personalizada o una "actualización" que descargaste de un enlace sospechoso, podrías haber infectado el dispositivo con malware. En ese caso:
Para estar seguro, ve a Ajustes > Acerca del dispositivo > Versión de Android y comprueba que la compilación corresponde a una versión oficial de Samsung para tu modelo y operador.